Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spsb3Q571F5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms