Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Spire1Q52KF3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spire1Q52KF3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.3 ms