Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Esf1Q3V1V3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Esf1Q3V1V3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Esf1Q3V1V3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Esf1Q3V1V3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Esf1Q3V1V3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Esf1Q3V1V3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Esf1Q3V1V3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Esf1Q3V1V3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Esf1Q3V1V3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Esf1Q3V1V3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Esf1Q3V1V3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Esf1Q3V1V3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Esf1Q3V1V3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Esf1Q3V1V3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Esf1Q3V1V3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms