Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC051142Q3V0M8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BC051142Q3V0M8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC051142Q3V0M8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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