Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87499Q3UX49 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms