Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Sec31aQ3UPL0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms