Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc33Q3ULW6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms