Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Babam1Q3UI43 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Babam1Q3UI43 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms