Protein–RNA interactions for Protein: Q3U552

A930003A15Rik, RIKEN cDNA A930003A15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930003A15RikQ3U552 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.7 ms