Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf6Q3TWW8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf6Q3TWW8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf6Q3TWW8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf6Q3TWW8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf6Q3TWW8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Srsf6Q3TWW8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Srsf6Q3TWW8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf6Q3TWW8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms