Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc10Q3TLI0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms