Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2f1Q3THK3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms