Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zfp444Q3TDV8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfp444Q3TDV8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Zfp444Q3TDV8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfp444Q3TDV8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfp444Q3TDV8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfp444Q3TDV8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfp444Q3TDV8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfp444Q3TDV8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfp444Q3TDV8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfp444Q3TDV8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms