Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Specc1lQ2KN98 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms