Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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ptchd1Q14B62 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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