Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc138Q0VF22 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms