Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MitfQ08874 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MitfQ08874 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MitfQ08874 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MitfQ08874 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MitfQ08874 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms