Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf9Q07105 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf9Q07105 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf9Q07105 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms