Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrx2Q06348 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms