Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mex3cQ05A36 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mex3cQ05A36 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms