Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1Q04750 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1Q04750 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1Q04750 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1Q04750 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Top1Q04750 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms