Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ascl1Q02067 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms