Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfdP97946 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfdP97946 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfdP97946 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfdP97946 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfdP97946 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfdP97946 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfdP97946 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfdP97946 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms