Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
rp9P97762 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
rp9P97762 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
rp9P97762 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
rp9P97762 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
rp9P97762 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
rp9P97762 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
rp9P97762 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
rp9P97762 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
rp9P97762 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
rp9P97762 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
rp9P97762 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
rp9P97762 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
rp9P97762 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
rp9P97762 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
rp9P97762 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
rp9P97762 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
rp9P97762 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
rp9P97762 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
rp9P97762 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
rp9P97762 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
rp9P97762 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
rp9P97762 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
rp9P97762 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
rp9P97762 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
rp9P97762 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
rp9P97762 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
rp9P97762 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
rp9P97762 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
rp9P97762 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
rp9P97762 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
rp9P97762 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
rp9P97762 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
rp9P97762 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
rp9P97762 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
rp9P97762 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
rp9P97762 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
rp9P97762 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
rp9P97762 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
rp9P97762 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
rp9P97762 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
rp9P97762 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
rp9P97762 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
rp9P97762 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
rp9P97762 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
rp9P97762 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
rp9P97762 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
rp9P97762 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
rp9P97762 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
rp9P97762 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
rp9P97762 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
rp9P97762 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
rp9P97762 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
rp9P97762 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
rp9P97762 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
rp9P97762 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
rp9P97762 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
rp9P97762 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
rp9P97762 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
rp9P97762 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
rp9P97762 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
rp9P97762 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
rp9P97762 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
rp9P97762 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
rp9P97762 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
rp9P97762 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
rp9P97762 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
rp9P97762 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
rp9P97762 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
rp9P97762 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
rp9P97762 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
rp9P97762 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
rp9P97762 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
rp9P97762 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
rp9P97762 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
rp9P97762 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
rp9P97762 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
rp9P97762 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
rp9P97762 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
rp9P97762 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
rp9P97762 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
rp9P97762 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
rp9P97762 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
rp9P97762 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
rp9P97762 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
rp9P97762 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
rp9P97762 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
rp9P97762 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
rp9P97762 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
rp9P97762 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
rp9P97762 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
rp9P97762 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
rp9P97762 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
rp9P97762 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
rp9P97762 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
rp9P97762 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
rp9P97762 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
rp9P97762 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
rp9P97762 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
rp9P97762 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms