Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Psme1P97371 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Psme1P97371 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Psme1P97371 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Psme1P97371 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Psme1P97371 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Psme1P97371 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Psme1P97371 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psme1P97371 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psme1P97371 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms