Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms