Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cct5P80316 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cct5P80316 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cct5P80316 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cct5P80316 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cct5P80316 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cct5P80316 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cct5P80316 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cct5P80316 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.6 ms