Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dlx4P70436 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dlx4P70436 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms