Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cux2P70298 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cux2P70298 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cux2P70298 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cux2P70298 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cux2P70298 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cux2P70298 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cux2P70298 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux2P70298 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cux2P70298 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cux2P70298 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cux2P70298 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cux2P70298 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cux2P70298 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms