Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hoxd13P70217 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms