Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms