Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Smg6P61406 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smg6P61406 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smg6P61406 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smg6P61406 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smg6P61406 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smg6P61406 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smg6P61406 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smg6P61406 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smg6P61406 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smg6P61406 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smg6P61406 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms