Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Romo1P60603 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Romo1P60603 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.6 ms