Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc1a3P56564 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a3P56564 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms