Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CartptP56388 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CartptP56388 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CartptP56388 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CartptP56388 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CartptP56388 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CartptP56388 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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CartptP56388 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CartptP56388 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CartptP56388 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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CartptP56388 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CartptP56388 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CartptP56388 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CartptP56388 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CartptP56388 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CartptP56388 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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CartptP56388 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CartptP56388 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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CartptP56388 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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CartptP56388 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CartptP56388 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CartptP56388 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CartptP56388 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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CartptP56388 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CartptP56388 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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CartptP56388 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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CartptP56388 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CartptP56388 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CartptP56388 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms