Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc4P54775 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc4P54775 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc4P54775 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc4P54775 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc4P54775 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc4P54775 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc4P54775 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc4P54775 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms