Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhox5P52651 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms