Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psen1P49769 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psen1P49769 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psen1P49769 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Psen1P49769 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psen1P49769 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psen1P49769 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psen1P49769 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms