Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atoh1P48985 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atoh1P48985 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms