Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp9P41245 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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