Protein–RNA interactions for Protein: P40142

Tkt, Transketolase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TktP40142 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TktP40142 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TktP40142 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TktP40142 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TktP40142 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TktP40142 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TktP40142 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TktP40142 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TktP40142 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TktP40142 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TktP40142 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TktP40142 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TktP40142 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TktP40142 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TktP40142 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TktP40142 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TktP40142 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TktP40142 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TktP40142 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TktP40142 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TktP40142 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TktP40142 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TktP40142 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TktP40142 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TktP40142 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TktP40142 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TktP40142 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TktP40142 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TktP40142 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TktP40142 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TktP40142 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TktP40142 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TktP40142 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TktP40142 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TktP40142 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TktP40142 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TktP40142 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TktP40142 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TktP40142 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TktP40142 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TktP40142 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TktP40142 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TktP40142 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TktP40142 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TktP40142 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TktP40142 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TktP40142 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TktP40142 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TktP40142 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TktP40142 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TktP40142 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TktP40142 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TktP40142 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TktP40142 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TktP40142 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TktP40142 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TktP40142 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TktP40142 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TktP40142 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TktP40142 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TktP40142 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TktP40142 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TktP40142 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TktP40142 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TktP40142 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TktP40142 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TktP40142 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TktP40142 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TktP40142 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TktP40142 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TktP40142 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TktP40142 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TktP40142 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TktP40142 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TktP40142 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TktP40142 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TktP40142 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TktP40142 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TktP40142 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TktP40142 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TktP40142 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TktP40142 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TktP40142 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TktP40142 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TktP40142 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TktP40142 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TktP40142 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TktP40142 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TktP40142 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TktP40142 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TktP40142 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TktP40142 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TktP40142 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TktP40142 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TktP40142 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TktP40142 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TktP40142 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TktP40142 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TktP40142 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TktP40142 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms