Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rom1P32958 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rom1P32958 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rom1P32958 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rom1P32958 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rom1P32958 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rom1P32958 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms