Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gsx2P31316 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gsx2P31316 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms