Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc10P31257 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc10P31257 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms