Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnga1P29974 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms