Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif3aP28741 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms