Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept4P28661 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept4P28661 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept4P28661 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sept4P28661 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sept4P28661 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept4P28661 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept4P28661 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept4P28661 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sept4P28661 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept4P28661 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept4P28661 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept4P28661 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept4P28661 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms