Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spi1P17433 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spi1P17433 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Spi1P17433 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Spi1P17433 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms