Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd5P13379 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd5P13379 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd5P13379 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd5P13379 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd5P13379 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd5P13379 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd5P13379 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd5P13379 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd5P13379 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd5P13379 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms