Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prf1P10820 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prf1P10820 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prf1P10820 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prf1P10820 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prf1P10820 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Prf1P10820 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Prf1P10820 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prf1P10820 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prf1P10820 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prf1P10820 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prf1P10820 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prf1P10820 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prf1P10820 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Prf1P10820 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prf1P10820 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prf1P10820 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prf1P10820 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prf1P10820 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms